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ChemBioOffice 13.0——生物化学绘图及计算软件

该软件包是为广大从事化学、生物研究领域的科研人员个人使用而设计开发的产品。同时,这个产品又可以共享解决方案,给研究机构的所有科技工作者带来效益。利用ChemBioOffice 你可以方便的进行化学生物结构绘图、分子模型及仿真、可以将化合物名称直接转为结构图,省去绘图的麻烦;也可以对已知结构的化合物命名,给出正确的化合物名称。

ChemOffice Ultra版包含以下功能模块:
ChemDraw模块 - 是世界上最受欢迎的化学结构绘图软件,是各论文期刊指定的格式。
Chem3D模块 - 提供工作站级的3D分子轮廓图及分子轨道特性分析,并和数种量子化学软件结合在一起。由于Chem3D提供完整的界面及功能,已成为分子仿真分析最佳的前端开发环境。
ChemPro模块 - 预测BP、MP、临界温度、临界气压、吉布斯自由能、 logP、折射率、热结构等性质。

ChemFinder模块- 化学信息搜寻整合系统,可以建立化学数据库、储存及搜索,或与ChemDraw、Chem3D联合使用,也可以使用现成的化学数据库。ChemFinder是一个智能型的快速化学搜寻引擎,所提供的ChemInfo信息系统是目前世界上最丰富的数据库之一,包含ChemACX、ChemINDEX、ChemRXN、ChemMSDX,并不断有新的数据库加入。ChemFinder可以从本机或网上搜寻Word,Excel,Powerpoint,ChemDraw和ISIS格式的分子结构文件。还可以与微软的Excel结合,可连结的关连式数据库包括Oracle及Access,输入的格式包括ChemDraw、MDL ISIS SD及RD文件。

ChemOffice WebServer - 化学网站服务器数据库管理系统您可将您的ChemDraw、Chem3D作品发表在网站上,使用者就可用ChemDraw Pro Plugin网页浏览工具,用www方式观看ChemDraw的图形,或用Chem3D Std插件中的网页浏览工具观看。
ChemBioOffice Ultra is the ultimate chemistry & biology suite designed to meet the needs of both chemists and biologists. ChemBioOffice Ultra allows scientists to efficiently keep track of their work, gain a deeper understanding of their data, correlate biological activity with chemical structures, and produce scientific reports more professionally and efficiently than ever before.

What’s New in Version 13.0
Announcing ChemBioOffice 13: The latest release of the Ultimate Software Suite for the Life Sciences, Featuring ChemBioDraw 13!

ChemBioOffice® 13 is the latest release of the ChemBioOffice suite of personal productivity tools for chemists and biologists. With this release, ChemBioOffice adds even more power to help scientists efficiently keep track of their work, visualize and gain a deeper understanding of their results and correlate biological activity with chemical structures.

ChemBioOffice 13 - Top Ten New Features
Enhanced biopolymer toolbar including D- and L-amino acids, beta amino acids, DNA and RNA

A new biopolymer toolbar enables creation of peptide, DNA and RNA sequences, including beta and D-amino acids, disulfide and lactam bridges and linkers and protecting groups. Draw peptides and nucleotide (DNA, RNA) sequences using 1- and 3- letter codes. Includes natural L-, unnatural D- and beta amino acids. Simply switch between 1- and 3- letter codes and expand and contract labels. Insert linking and protecting groups with simple type-ahead functionality. Use the bond tool to create disulfide and lactam bridges, and cyclic peptides

"The new Biopolymer Toolbar is a huge help to draw peptides or DNA sequences. It is easy to handle and saves a lot of time." Dr. Richard J. Smith , Associate Editor, Verlag Helvetica Chimica Acta

Combine and mix sequences, linkers, and protecting groups in single entities.
Add protecting groups such as Trt and Fmoc to amino acids containing additional NH2 or OH groups (Arg, Aad). Expand and contract the protected residues like other residues. Merge multiple sequences into one sequence by bonding together their terminal residues.

Paste sequences from external sources with full chemistry and control over layout
Paste sequences in the FASTA format. Copy a text string describing a biopolymer as a series of single or multi letter residues, with valid separators (space, tab, dash), and paste it as a sequence. The text string can be generated within or outside of ChemBioDraw.

"...it has made navigating the creation of structures easy as well as calculating many of their properties. I’m always pleased by how each iteration of ChemDraw is better than the last and it is an indispensable program to my science." Dr. Jeremiah J. Gassensmith, Northwestern University

Enhanced clean-up tools for molecules, reactions and biopolymers
Use advanced clean-up tools for molecules, reactions and biopolymers to create attractive and accurate diagrams. Sequences will be automatically cleaned following expansion. When you contract a sequence, the Clean-Up Biopolymer command cleans, and re-arranges the sequence so that the residues are aligned, and wrapped.

"...smart and simple features for getting structures done quickly and correctly..." Long term ChemBioOffice User

Save to Dropbox for cloud storage and collaboration
Use cloud storage to save, share and import structures, reactions drawings and 3D models with scientists around the world.

New property predictors for pKa, LogD and LogS
Explore important bioavailability properties such as acid dissociation, distribution and aqueous solubility for putative compounds using specialized calculators for pKa, LogD and LogS.

New Gel Electrophoresis tool
Draw gel electrophoresis plates using this new tool that provides arbitrary rotation for lane labels, drag and position band labels, paste data from Microsoft® Excel® spreadsheets or other sources, and copy and paste between lanes .

Interface to AutoDock for flexible ligand docking
AutoDock helps you determine how one or more small molecules may be arranged to fit inside the cavity of a larger molecule. You choose the molecules, the cavity binding sites, and calculation parameters. AutoDock calculates and displays the conformers and positions of each small molecule that fit your requirements.

"I have just run Autodock using the default ligand and am amazed at the results... the ChemBio3D interface is markedly easy to use... the speed of execution, albeit for a rather small molecule is the fastest I’ve seen in a MS OS. Well done!" Stephen Molnar Ph.D., Foundation for Chemistry

Interface to CONFLEX® for conformational analysis and detection of minimum energy conformers
Set up CONFLEX® runs to quickly explore conformational space and identify minimum energy conformations for small and large molecules. Using CONFLEX, you can search for low energy conformers of a model and create a fragment for each one in its optimal state.

Modern splash screens and updated and clarified icons
"...the best chemistry drawing application for Mac, hands down. It has a clean and simple, yet powerful and flexible interface both for novices and experts." Prof. Dr. Gabriel Dorado Universidad de Cordoba